但目前來看，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖技術(shù)和系統(tǒng)的推廣還存在以下問題：是基礎(chǔ)建設(shè)成本高，投入大?，F(xiàn)在采用循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的企業(yè)大多數(shù)為具有一定規(guī)模，技術(shù)力量和實(shí)力較為雄厚的養(yǎng)殖企業(yè)，而對(duì)大部分小本經(jīng)營(yíng)的養(yǎng)殖戶（單位）來說是可望而不可即，這也使循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)和技術(shù)的大范圍推廣受到了制約。部分工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于設(shè)計(jì)存在問題或其他一些人為原因，運(yùn)行不充分或運(yùn)行效率較低，影響了工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的總體水平，節(jié)水節(jié)能技術(shù)路線有待進(jìn)一步探討、完善。
網(wǎng)狀濾料過濾池和調(diào)節(jié)池并聯(lián)設(shè)置下部相通，取用網(wǎng)狀濾料，上覆濾網(wǎng)片，調(diào)節(jié)池為補(bǔ)充水、pH濃度調(diào)節(jié)、加溫、設(shè)置氣提管，本項(xiàng)發(fā)明投資低、效率高、運(yùn)行成本低、節(jié)能省電，有利于促進(jìn)我國(guó)工廠化循環(huán)水養(yǎng)魚事業(yè)發(fā)展。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖因具有節(jié)地、節(jié)水、環(huán)境友好、生產(chǎn)可控等特點(diǎn)，被認(rèn)為是21世紀(jì)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)重要的發(fā)展方向之一，但是現(xiàn)在因?yàn)橥顿Y和運(yùn)行成本相對(duì)比較高，其發(fā)展一直受到一定程度的制約。
循環(huán)水系統(tǒng)處理的對(duì)象一般是含有大量固體懸浮物或溶解性的物質(zhì)，這些物質(zhì)排入到養(yǎng)殖水中后會(huì)在細(xì)菌的作用下，分解成氨、硫化氫等對(duì)水生動(dòng)物有毒的物質(zhì)。因此，一時(shí)間將這些污染物截留并盡可能地將這些污染物變廢為寶，是循環(huán)水處理系統(tǒng)的功能所在。循環(huán)水處理系統(tǒng)首先包括機(jī)械過濾部分。這些設(shè)備會(huì)將水中的固體懸浮物在一時(shí)間過濾出來。經(jīng)常用到的設(shè)備是蛋白質(zhì)分離器、微濾機(jī)、精密過濾器等設(shè)備。其次，循環(huán)水處理系統(tǒng)還有生化過濾設(shè)備。這些設(shè)備是為了培養(yǎng)相應(yīng)的微生物來對(duì)水中溶解性物質(zhì)進(jìn)行分解分離的。