工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)是以工業(yè)化手段主動控制水環(huán)境，水資源消耗小、占地少、對環(huán)境污染小、產(chǎn)品優(yōu)質(zhì)安全、病害少、密度高、養(yǎng)殖生產(chǎn)不受地域或氣候的限制和影響，資源利用率高，是高投入高產(chǎn)出，低風(fēng)險實(shí)現(xiàn)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展的重要途徑。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖采取集約化生產(chǎn)方式，減少了人力成本，降低了餌料系數(shù)。10%的養(yǎng)殖面積產(chǎn)出百分百的產(chǎn)量，這僅僅是其優(yōu)勢之一，更加環(huán)保的養(yǎng)殖方式，也提高了養(yǎng)殖品種的品質(zhì)，可以獲得更好的產(chǎn)品售價和經(jīng)濟(jì)效益。消費(fèi)者對高品質(zhì)的水產(chǎn)品需求日益增長，傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式產(chǎn)出的水產(chǎn)品沒有太多的附加值空間，利潤小，風(fēng)險高，已經(jīng)很難適應(yīng)高端消費(fèi)者的需求。
20世紀(jì)90年代，在淡水養(yǎng)殖方面，隨著經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展，全國各地興建了很多水產(chǎn)養(yǎng)殖示范區(qū)，建立了一批淡水魚類工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，但是其經(jīng)濟(jì)性矛盾依然突出。而工廠化循環(huán)水苗種繁殖生產(chǎn)系統(tǒng)具有水環(huán)境可控、苗種質(zhì)量高等優(yōu)點(diǎn)，適應(yīng)了苗種生產(chǎn)的反季節(jié)性、水質(zhì)條件要求高的特點(diǎn)，并且苗種的單位產(chǎn)值高，使之得到了一定程度的應(yīng)用。以大菱鲆工廠化流水養(yǎng)殖為代表的海水工廠化養(yǎng)殖的大力推廣，隨之而來的是優(yōu)質(zhì)水資源大量耗用，尤其是地下水資源，造成地下水位下降、地陷等諸多問題。“九五”以來，國家有關(guān)科研計(jì)劃大力支持海水工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的研究，并取得了重要的階段性成果。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)不僅節(jié)能節(jié)水效果較好，而且還對防止養(yǎng)殖病害發(fā)生、實(shí)現(xiàn)養(yǎng)殖過程零用藥、提高產(chǎn)品質(zhì)量和經(jīng)濟(jì)效益發(fā)揮重要的作用。