高密的養(yǎng)殖下，一旦系統(tǒng)崩潰、疾病爆發(fā)或循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)運(yùn)行的穩(wěn)定性和系統(tǒng)總水量的平衡、生物濾池的維護(hù)、過濾設(shè)施的定期清理、合理的投喂策略、適宜的養(yǎng)殖密度以及水質(zhì)的檢測(cè)和疾病的預(yù)防都是分不開的。因此，循環(huán)水系統(tǒng)的科學(xué)有效運(yùn)行是多學(xué)科知識(shí)的綜合體現(xiàn)。研究調(diào)查發(fā)現(xiàn)，很多企業(yè)對(duì)循環(huán)水養(yǎng)殖的原理、水處理設(shè)施設(shè)備的作用、運(yùn)行參數(shù)等知之甚少，直接影響到系統(tǒng)的運(yùn)行管理。較高的進(jìn)入門檻也進(jìn)一步加大了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的推廣難度。
在使用循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)后，企業(yè)能耗費(fèi)用明顯降低，養(yǎng)殖池水經(jīng)過處理后循環(huán)使用，降低了企業(yè)取水成本，水質(zhì)明顯提高，魚蝦發(fā)生病害幾率迅速降低，每年可為企業(yè)節(jié)約費(fèi)用達(dá)幾十萬元。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖模式具有節(jié)水、節(jié)地、生態(tài)環(huán)保、生產(chǎn)可控性強(qiáng)、高密度、低風(fēng)險(xiǎn)、水產(chǎn)品質(zhì)量安全等優(yōu)點(diǎn)，被認(rèn)為是代表21世紀(jì)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的主導(dǎo)方向之一。我國作為世界水產(chǎn)養(yǎng)殖大國，推廣工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖模式。推進(jìn)水產(chǎn)養(yǎng)殖技術(shù)向高端、精準(zhǔn)、節(jié)能、高產(chǎn)的方向發(fā)展。
循環(huán)水系統(tǒng)處理的對(duì)象一般是含有大量固體懸浮物或溶解性的物質(zhì)，這些物質(zhì)排入到養(yǎng)殖水中后會(huì)在細(xì)菌的作用下，分解成氨、硫化氫等對(duì)水生動(dòng)物有毒的物質(zhì)。因此，一時(shí)間將這些污染物截留并盡可能地將這些污染物變廢為寶，是循環(huán)水處理系統(tǒng)的功能所在。循環(huán)水處理系統(tǒng)首先包括機(jī)械過濾部分。這些設(shè)備會(huì)將水中的固體懸浮物在一時(shí)間過濾出來。經(jīng)常用到的設(shè)備是蛋白質(zhì)分離器、微濾機(jī)、精密過濾器等設(shè)備。其次，循環(huán)水處理系統(tǒng)還有生化過濾設(shè)備。這些設(shè)備是為了培養(yǎng)相應(yīng)的微生物來對(duì)水中溶解性物質(zhì)進(jìn)行分解分離的。