南通國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR原理

       數(shù)字PCR(d PCR)是近年來引起重視并迅速發(fā)展起來的一種突破性的核酸定量分析技術(shù)。該技術(shù)先將核酸模板進(jìn)行稀釋,分配到大量**的反應(yīng)單元中,使每個(gè)反應(yīng)單元中只有單個(gè)模板分子,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)束后對(duì)每個(gè)反應(yīng)室的熒光信號(hào)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,來定量DNA拷貝數(shù)。數(shù)字PCR采用先擴(kuò)增后定量,因此不依賴擴(kuò)增曲線的循環(huán)閾值(Ct),也無需采用內(nèi)參基因和標(biāo)準(zhǔn)曲線,準(zhǔn)確度高、重現(xiàn)性好,可以實(shí)現(xiàn)***定量分析。由于其獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢(shì),已經(jīng)在臨床診斷、轉(zhuǎn)基因成分定量、單細(xì)胞基因表達(dá)分析、環(huán)境微生物檢測(cè)和下一代測(cè)序等研究領(lǐng)域顯示出巨大的優(yōu)勢(shì)和應(yīng)用前景。高靈敏度——數(shù)字PCR的靈敏度與同體積反應(yīng)體系的分割份數(shù)成正比。南通國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR原理

相對(duì)于二代測(cè)序、基因芯片和定量PCR而言，數(shù)字PCR具備以下優(yōu)勢(shì):

● 靈敏度可達(dá)到單個(gè)核酸分子：檢測(cè)限低至0.001%，主要系為數(shù)字PCR可以實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)DNA/RNA的生物濃縮；

● 無需標(biāo)準(zhǔn)曲線活參照基因進(jìn)行對(duì)比來測(cè)定核算量，可對(duì)靶分子起始量進(jìn)行***定量，直接獨(dú)處DNA分子的個(gè)數(shù)；

● 適合環(huán)境復(fù)雜樣品的檢測(cè)：終點(diǎn)PCR檢測(cè)，不依賴Ct值，不依賴擴(kuò)增效率，能克服PCR***劑的影響，避免樣品間的交叉***問題，適合各類復(fù)雜環(huán)境中的樣本進(jìn)行***定量，如動(dòng)血樣、糞便、尿液、痰液、水樣、土壤、植物等； 南京微流控芯片數(shù)字PCR銷售電話液體活檢：早篩、用藥、監(jiān)測(cè)、復(fù)發(fā)。

       數(shù)字PCR檢測(cè)及分析原理在上世紀(jì)90年代就被提出來了，但是無奈受限于當(dāng)時(shí)的技術(shù)條件，樣本稀釋及分配都是靠手工來完成的，受到很多因素的干擾和限制；并且結(jié)果分析對(duì)于研究者來說也十分枯燥與繁瑣，因此在很長(zhǎng)一段時(shí)間dPCR發(fā)展停滯不前。后來由于微流控技術(shù)與微納集成制造工藝的發(fā)展解決了dPCR過程中的幾個(gè)關(guān)鍵技術(shù)問題，推動(dòng)了dPCR的研究與商業(yè)化的發(fā)展。

       目前根據(jù)dPCR樣本稀釋分配的方式，基本可分為三大類，一種是基于大規(guī)模集成微流控芯片；第二種是使用微反應(yīng)室/孔板；第三種是微滴式。但不論是走芯片式還是微滴式，其基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或者微滴當(dāng)中，每個(gè)反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于1或者等于1。經(jīng)過PCR擴(kuò)增之后，有一個(gè)核酸分子的模板的反應(yīng)器就會(huì)給出熒光信號(hào)，沒有模板的反應(yīng)器沒有熒光信號(hào)。根據(jù)相對(duì)比例和反應(yīng)器的體積，可以推算出原始溶液的核酸濃度。

       數(shù)字PCR（Digital PCR-dPCR）技術(shù)是一種新的核酸檢測(cè)和定量方法，與傳統(tǒng)定量PCR（qPCR）技術(shù)不同，數(shù)字PCR采用***定量的方式，不依賴于標(biāo)準(zhǔn)曲線和參照樣本，直接檢測(cè)目標(biāo)序列的拷貝數(shù)。由于這種檢測(cè)方式具有比傳統(tǒng)qPCR更加出色的靈敏度和特異性、精確性，dPCR迅速得到***的應(yīng)用，這項(xiàng)技術(shù)在極微量核酸樣本檢測(cè)、復(fù)雜背景下稀有突變檢測(cè)和表達(dá)量微小差異鑒定方面變現(xiàn)出的優(yōu)勢(shì)已被普遍認(rèn)可，而其在基因表達(dá)研究、microRNA研究、基因組拷貝數(shù)鑒定、**標(biāo)志物稀有突變檢測(cè)、致病微生物鑒定、轉(zhuǎn)基因成分鑒定、NGS測(cè)序文庫精確定量和結(jié)果驗(yàn)證等諸多方面具有的廣闊應(yīng)用前景已經(jīng)受到越來越多的關(guān)注。分辨率——低至0.1倍基因表達(dá)差異。

二代測(cè)序輔助建庫

       目前靶向測(cè)序建庫方法包括擴(kuò)增子方法，在均相溶液中，當(dāng)擴(kuò)增引物增加時(shí)，由于擴(kuò)增引物之間的相互作用，從而影響擴(kuò)增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴(kuò)增，將可降低引物間相互作用，提高擴(kuò)增效率。同時(shí)還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)于少量模板的有效擴(kuò)增，得到更多的有效測(cè)序數(shù)據(jù)。

CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗(yàn)證

       CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明，是基因編輯技術(shù)的一大突破，但如何驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)是否成功，仍需要高靈敏度的檢測(cè)方法，數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團(tuán)隊(duì)發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對(duì)核酸進(jìn)行高靈敏度的定性檢測(cè)，但精確定量評(píng)估時(shí)仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)。 關(guān)于病原菌的檢測(cè)鑒定。南通國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR原理

國(guó)內(nèi)擁有完全自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的微滴式數(shù)字PCR儀。南通國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR原理

       在定量PCR時(shí)，我們常常糾結(jié)一個(gè)問題，究竟是相對(duì)定量還是***定量呢？如今，你無需糾結(jié)了，因?yàn)閿?shù)字PCR（digital PCR）來了。盡管這兩種技術(shù)有些類似，都是估計(jì)起始樣品中的核酸量，但它們有一個(gè)重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測(cè)定核酸量，而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù)，是對(duì)起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域：拷貝數(shù)變異、突變檢測(cè)、基因相對(duì)表達(dá)研究（如等位基因不平衡表達(dá)）、二代測(cè)序結(jié)果驗(yàn)證、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等。南通國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR原理

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