南通廣東數(shù)字PCR如何選型

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-10-13

dPCR的基本原理

       目前dPCR主要有兩種形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個(gè)反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個(gè)。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個(gè)核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度??梢允褂脦追N不同的方法來分配樣品,包括微孔板,毛細(xì)管,油乳劑和帶有核酸結(jié)合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過假設(shè)分子種群遵循泊松分布來估計(jì)不同分子的數(shù)量,根據(jù)泊松分布的原理,反應(yīng)體系中目標(biāo)分子的拷貝數(shù)可以通過公式A=-ln[(N-X)/N]*N計(jì)算,從而解決了多個(gè)目標(biāo)分子存在于單個(gè)液滴中的可能性。 單細(xì)胞研究:測序、PCR。南通廣東數(shù)字PCR如何選型

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       CNV(Copy Number Variations,拷貝數(shù)變異)研究需要極高的定量精度以區(qū)別不同拷貝數(shù)之間的微小差異,測序方法適用于高于30%的變異率檢測,而qPCR的比較**辨在1.5倍左右,數(shù)字PCR通過直接計(jì)數(shù)目標(biāo)基因與參照基因( 拷貝數(shù)為1的基因,例如RNaseP) 的數(shù)目,計(jì)算比值,直接得到目標(biāo)基因的拷貝數(shù)可以達(dá)到極高的拷貝數(shù)分辨精度。


       除此之外,dPCR在病原微生物檢測、microRNA研究、基因表達(dá)研究、NGS測序文庫的***定量、表觀遺傳學(xué)直接相關(guān)的DNA甲基化定量檢測、ChIP定量鑒定等領(lǐng)域的應(yīng)用都令人極為期待,而在轉(zhuǎn)基因成分鑒定、分子標(biāo)準(zhǔn)品精確定量、環(huán)境樣本檢測等具體的應(yīng)用方向上,已經(jīng)有大量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和結(jié)果證明了dPCR技術(shù)的優(yōu)良性能。


南通廣東數(shù)字PCR如何選型液體活檢:早篩、用藥、監(jiān)測、復(fù)發(fā)。

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定量PCR和數(shù)字PCR的特點(diǎn):


1. 在20多年的使用和發(fā)展中,定量PCR作為一種技術(shù)平臺,已經(jīng)產(chǎn)出海量的數(shù)據(jù),在工業(yè)界和分子檢測的某些應(yīng)用上,定量PCR已經(jīng)成為“金標(biāo)準(zhǔn)”。基礎(chǔ)研究方面,則形成了被稱為MIQE的“定量PCR標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)指南”。   

2. 在定量PCR的各種應(yīng)用中,基因表達(dá)分析(gene expression analysis)的應(yīng)用比重約占七成,綜合各種因素來看,眼下定量PCR還是進(jìn)行基因表達(dá)研究的理想手段。   

3. 上述的“各種因素”具體展開,主要包括:通量、自動化程度、各種檢測探針與染料、檢測通道、成本和可參考文獻(xiàn)與protocol的數(shù)目等等。   

4. 就目前市場上已有的數(shù)字PCR設(shè)備來看,定量PCR在檢測的線性范圍上具有優(yōu)勢,意味著同一個(gè)run內(nèi)可對各種表達(dá)豐度的樣品進(jìn)行分析。



       數(shù)字PCR可以直接計(jì)算目標(biāo)序列的拷貝數(shù),因此無需依賴于對照樣品和標(biāo)準(zhǔn)曲線就可以進(jìn)行精確的***定量檢測;此外,由于數(shù)字PCR在進(jìn)行結(jié)果判讀時(shí)*判斷有/無兩種擴(kuò)增狀態(tài),因此也不需要檢測熒光信號與設(shè)定閾值線的交點(diǎn),完全不依賴于Ct值的鑒定,因此數(shù)字PCR的反應(yīng)受擴(kuò)增效率的影響**降低,對PCR反應(yīng)***物的耐受能力**提高;數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)中標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系分配的過程可以極大程度上降低與目標(biāo)序列有競爭性作用的背景序列濃度,因此數(shù)字PCR技術(shù)也特別適合在復(fù)雜背景中檢測稀有突變。不依賴Ct值,無需標(biāo)準(zhǔn)曲線。

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       微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)為微流控微滴生成技術(shù),采用原創(chuàng)性的油液,單個(gè)樣本在微米級流道中利用氣壓驅(qū)動在3分鐘內(nèi)生成10萬微滴,單次運(yùn)行生成80萬微滴,微滴體積達(dá)皮升級,檢測線性范圍達(dá)到6個(gè)數(shù)量級,各項(xiàng)指標(biāo)均超越國內(nèi)外主流產(chǎn)品。


       在液滴生成數(shù)上,MicroDrop?能達(dá)到國外同級別產(chǎn)品的5倍。與此同時(shí),設(shè)備制作成本只有國外同類產(chǎn)品的一半。這減低了精細(xì)醫(yī)療的成本,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領(lǐng)域的壟斷。這意味著在未來,采用外周血、唾液、尿液、腦脊液等樣本進(jìn)行低成本、高靈敏、快速的無創(chuàng)檢測成為可能。


國內(nèi)擁有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的微滴式數(shù)字PCR儀。南通廣東數(shù)字PCR如何選型

MiniDrop?研發(fā)團(tuán)隊(duì)由微流控、光學(xué)、機(jī)電學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)等多學(xué)科交叉領(lǐng)域的**組成。南通廣東數(shù)字PCR如何選型

數(shù)字PCR的應(yīng)用

檢驗(yàn)檢疫 食品安全

?轉(zhuǎn)基因食品檢測(國標(biāo))

?病原菌鑒定

?動物源性檢測分析



科研

?基因表達(dá)差異監(jiān)測

?CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗(yàn)證

?甲基化含量鑒定

?單細(xì)胞研究:測序、PCR



臨床

?**液體活檢:早篩、用藥、監(jiān)測、復(fù)發(fā)

?無創(chuàng)產(chǎn)前篩查:低成本、快速

?***性疾?。篐BV、HIV定量


       據(jù)悉,MiniDrop?**團(tuán)隊(duì)由微流控、光學(xué)、機(jī)電學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)等多學(xué)科交叉領(lǐng)域的**組成,依托精密儀器研發(fā)、生物納米材料與分子生物學(xué)等平臺,以微滴式數(shù)字PCR儀為**,打造了全自動液體處理工作站、核酸提取試劑盒等創(chuàng)新產(chǎn)品,致力于解決**、***領(lǐng)域的精細(xì)診斷。


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