南京Co IP免疫沉淀外包公司

來源： 發(fā)布時(shí)間：2024-07-24

ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實(shí)驗(yàn)是一種強(qiáng)大的技術(shù)，用于研究蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用，尤其是在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)、復(fù)制以及表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域。然而，像所有實(shí)驗(yàn)技術(shù)一樣，ChIP實(shí)驗(yàn)也有其優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn)。
ChIP實(shí)驗(yàn)的優(yōu)點(diǎn)：
1. 體內(nèi)反應(yīng)的反映：ChIP提供了一種在體內(nèi)研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的方法，能夠真實(shí)、完整地反映結(jié)合在DNA序列上的靶蛋白的調(diào)控信息。
2. 全基因組覆蓋：ChIP技術(shù)可以覆蓋整個(gè)基因組，提供關(guān)于蛋白質(zhì)-DNA相互作用的視圖。
3. 適用于多種蛋白質(zhì)：ChIP可以用來研究組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子以及其他DNA結(jié)合蛋白。
ChIP實(shí)驗(yàn)的缺點(diǎn)：
1. 實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣。
2. 需要大量起始材料：ChIP實(shí)驗(yàn)通常需要大量的細(xì)胞或組織作為起始材料。
3. 交聯(lián)的影響：使用交聯(lián)劑可能會(huì)改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，從而影響抗體的識(shí)別和蛋白質(zhì)-DNA的相互作用。
4. 染色質(zhì)碎裂的分辨率：染色質(zhì)碎裂的效率和分辨率直接影響ChIP的準(zhǔn)確性，需要優(yōu)化以獲得結(jié)果。
5. 抗體質(zhì)量：抗體的質(zhì)量對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果至關(guān)重要，但高質(zhì)量、特異性強(qiáng)的抗體可能難以獲得或成本較高。
免疫沉淀技術(shù)Co-IP的原理是什么？南京Co IP免疫沉淀外包公司

南京Co IP免疫沉淀外包公司,免疫沉淀

免疫沉淀技術(shù)（Immunoprecipitation, IP）的實(shí)驗(yàn)步驟通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)：
1. 細(xì)胞裂解：首先需要收集細(xì)胞并裂解它們，以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成，以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清：裂解后的細(xì)胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞，從而獲得上清。
3. 抗體的添加：將特定于目標(biāo)蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白上。
4. 免疫復(fù)合物的形成：抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲：使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌：捕獲免疫復(fù)合物后，需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌，以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫：免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進(jìn)行洗脫，這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來，或者使用低pH緩沖液進(jìn)行溫和洗脫，以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象。
8. 分析：洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot等方法進(jìn)行分析，以驗(yàn)證目標(biāo)蛋白的存在和狀態(tài)。
廣州Protein AG免疫沉淀磁珠的選擇免疫沉淀技術(shù)Co-IP的實(shí)驗(yàn)方法。

南京Co IP免疫沉淀外包公司,免疫沉淀

ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)方法概述：
1. 交聯(lián)：將細(xì)胞與交聯(lián)劑（如1%甲醛）孵育，通常在室溫下進(jìn)行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián)：添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應(yīng)，孵育5分鐘。
3. 收集細(xì)胞：通過離心收集細(xì)胞，并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細(xì)胞裂解：使用裂解緩沖液裂解細(xì)胞，釋放染色質(zhì)。
5. 染色質(zhì)剪切：使用超聲波或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段。
6. 免疫沉淀：將剪切后的染色質(zhì)與特異性抗體孵育，然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌：用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠，去除非特異性結(jié)合物。
8. 洗脫：用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián)：用蛋白酶K處理，然后在65°C下加熱過夜以逆轉(zhuǎn)交聯(lián)。
10. DNA純化：使用商業(yè)試劑盒或標(biāo)準(zhǔn)酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析：使用qPCR分析富集的DNA，或進(jìn)行測序以確定蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)。

免疫沉淀ChIP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu)，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng)，而磁珠在得率，可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀技術(shù)IP的優(yōu)缺點(diǎn)是什么？

南京Co IP免疫沉淀外包公司,免疫沉淀

真核生物的基因組 DNA 以染色質(zhì)（Chromatin）的形式存在。因此，研究蛋白質(zhì)與 DNA 在染色質(zhì)環(huán)境中的相互作用是闡明真核生物基因表達(dá)機(jī)制的基本途徑，而染色質(zhì)免疫共沉淀（Chromatinimmunoprecipitation，ChIP）技術(shù)是目前公認(rèn)的研究此相互作用的選擇，是真核生物基因表達(dá)機(jī)制研究中不可或缺的技術(shù)之一。
它的基本原理是在活細(xì)胞狀態(tài)下，固定蛋白質(zhì)-DNA（染色質(zhì)）復(fù)合物，并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段，然后通過免疫學(xué)方法（抗體親和）沉淀此復(fù)合體，特異性地富集目的蛋白結(jié)合的 DNA，通過對(duì)目的片段的純化與后期檢測，從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
免疫沉淀Co-IP抗體的選擇？溫州anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠的選擇

免疫沉淀RIP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠？南京Co IP免疫沉淀外包公司

免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因：
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低，則有幾種方法可以進(jìn)行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標(biāo)分子的共純化。此外，還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中會(huì)出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會(huì)影響下游分析，則需要使用抗體通過共價(jià)連接固定至微珠的方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
南京Co IP免疫沉淀外包公司

標(biāo)簽： 支原體 免疫沉淀