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來源: 發(fā)布時間:2022-05-13

聚合酶鏈式反應的常見問題:出現(xiàn)非特異性擴增帶:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶 與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數過多有關。其次是酶的質和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:必要時重新設計引 物。減低酶量或調換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環(huán)次數。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。重疊延伸聚合酶鏈反應:一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。廈門實時Real-time PCR供應商

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聚合酶鏈反應的一個主要限制是,為了產生允許其選擇性擴增的引物,需要關于目標序列的先前信息。這意味著,通常情況下,PCR用戶必須知道兩個單鏈模板中每個模板上目標區(qū)域上游的精確序列,以確保DNA聚合酶正確結合引物-模板雜交體,并隨后在DNA合成過程中產生整個目標區(qū)域。像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯,這反過來會導致產生的PCR片段發(fā)生突變。PCR的另一個限制是,即使是很少量的污染DNA也可以被擴增,導致誤導或模糊的結果。為了很大限度地減少污染的可能性,調查人員應該為試劑制備、聚合酶鏈反應和產品分析預留單獨的房間。試劑應分配到一次性的等分試樣中。應經常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。杭州微量PCR檢測技術聚合酶鏈式反應是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術。

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聚合酶鏈式反應準備:引物內部不應出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是很末及倒數第二個堿基,應嚴格要求配對,很好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。

聚合酶鏈式反應:定量PCR允許實時定量和檢測特定的DNA序列,因為它在合成過程中測量濃度。有兩種方法可以同時檢測和定量。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標記的探針。只有在探針與其互補DNA雜交后,才能使用這些方法檢測DNA。一種有趣的技術組合是實時PCR和逆轉錄。這種復雜的技術被稱為RT-qPCR,允許定量少量RNA。通過這種組合技術,mRNA被轉化為cDNA,并用qPCR進一步定量。這種技術降低了聚合酶鏈反應終點出錯的可能性,增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關的基因的機會。實驗室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調控。聚合酶鏈反應應經常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。

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聚合酶鏈式反應準備:PCR引物設計:PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。引物設計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。聚合酶鏈反應的一個主要限制是,為了產生允許其選擇性擴增的引物,需要關于目標序列的先前信息。無錫骨頭定量PCR應用

聚合酶鏈反應很容易理解和使用,并迅速產生結果。廈門實時Real-time PCR供應商

逆轉錄-聚合酶鏈反應的原理是:提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。完整RNA 的提取和純化,是進行RNA 方面的研究工作,如Nothern雜交、mRNA 分離、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及體外翻譯等的前提。所有RNA的提取過程中都有五個關鍵點,即樣品細胞或組織的有效破碎;有效地使白復合體變性;對內源RNA酶的有效抑制;有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;對于多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質的有效除去。但其中很關鍵的是抑制RNA酶活性。RNA 的提取目前階段主要可采用兩種途徑,提取總核酸,再用氯化鋰將RNA 沉淀出來;直接在酸性條件下抽提,酸性下DNA與蛋白質進入有機相而RNA 留在水相。種提取方法將導致小分子量RNA 的丟失,目前該方法的使用頻率已很低。廈門實時Real-time PCR供應商