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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的很大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加?;蚬こ蹋荷锊牧稀猰RNA,將mRNA反轉(zhuǎn)錄后成為cDNA(互補(bǔ)DNA),通過(guò)PCR擴(kuò)增。這里不是信使RNA,而是病毒RNA作為生物材料進(jìn)行PCR聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。作用——體外將病毒RNA分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行修飾,其次將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞中,進(jìn)行病。RNA的表現(xiàn)形式:RNA病毒一般由蛋白質(zhì)和RNA組成,現(xiàn)在看下RNA——一條核糖核酸長(zhǎng)鏈,核糖核酸長(zhǎng)鏈由無(wú)數(shù)個(gè)核糖核苷酸分子構(gòu)成,其中,一個(gè)核糖核苷酸分子由一分子磷酸、一分子核糖(一種五碳糖)、一分子含氮堿基構(gòu)成。脫氧核糖核苷酸分子比核糖核苷酸分子少了一個(gè)O分子。PCR反應(yīng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用。莆田實(shí)時(shí)PCR檢測(cè)技術(shù)研究方案
聚合酶鏈反應(yīng):在檢測(cè)病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標(biāo)準(zhǔn) .但是對(duì)于一些苛養(yǎng)菌 生長(zhǎng)緩慢的細(xì)菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽(yáng)性檢出率不高.檢測(cè)時(shí)間過(guò)長(zhǎng) 無(wú)法滿足臨床早期快速診斷以指導(dǎo)醫(yī)治的需要[3]。當(dāng)前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應(yīng)用的基礎(chǔ)上進(jìn)行的改進(jìn),包括實(shí)時(shí)定量 PCR 技術(shù) 、 實(shí)時(shí)熒光定量PCR、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) 、 巢式PCR等。 在PCR技術(shù)的輔助作用下,實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)也逐漸從生化免疫診斷過(guò)渡到基因診斷,生化免疫檢測(cè)主要從表型表現(xiàn)評(píng)估病癥,而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因,以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應(yīng)用價(jià)值,在未來(lái)的臨床醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中必將會(huì)得到更加較廣的應(yīng)用。無(wú)錫微量RT-PCR檢測(cè)技術(shù)供應(yīng)商聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是80年代中期發(fā)展起來(lái)的體外核酸擴(kuò)增技術(shù)。
聚合酶鏈反應(yīng)的常見問(wèn)題分析與解決方法:PCR產(chǎn)物量過(guò)少:退火溫度不合適。以2度為梯度設(shè)計(jì)梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。DNA模板量太少。增加DNA模板量。PCR循環(huán)數(shù)不足。增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)。引物量不足。增加體系中引物含量。延伸時(shí)間太短。以1 kb/min的原則設(shè)置延伸時(shí)間。變性時(shí)間過(guò)長(zhǎng)。變性時(shí)間過(guò)長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致DNA聚合酶失活。DNA模板中存在抑制劑。確保DNA模板干凈。擴(kuò)增產(chǎn)物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散:酶量過(guò)高。減少酶量;酶的質(zhì)量差,調(diào)換另一來(lái)源的酶。dNTP濃度過(guò)高。減少dNTP的濃度。
聚合酶鏈反應(yīng)同時(shí)擴(kuò)增單個(gè)精子中幾個(gè)基因座的能力]增強(qiáng)了極大地增強(qiáng)了通過(guò)研究減數(shù)分裂后染色體交叉來(lái)進(jìn)行基因定位的傳統(tǒng)任務(wù)。通過(guò)分析數(shù)千個(gè)單個(gè)精子,已經(jīng)直接觀察到非常緊密基因座之間罕見的交叉事件。類似地,可以分析異常的缺失、插入、易位或倒位,所有這些都無(wú)需等待(或支付)漫長(zhǎng)而艱苦的受精、胚胎發(fā)生等過(guò)程。定點(diǎn)突變:聚合酶鏈反應(yīng)可用于產(chǎn)生突變基因,突變由科學(xué)家隨意選擇。可以選擇這些突變來(lái)理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質(zhì)功能。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜,以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列。
PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過(guò)高會(huì)加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過(guò)高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過(guò)高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無(wú)校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過(guò)長(zhǎng)使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長(zhǎng)度在15~25時(shí)退火溫度。聚合酶鏈反應(yīng)應(yīng)經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長(zhǎng)移液器吸頭的移液器。南通骨頭RT-PCR檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用
電子聚合酶鏈反應(yīng)用于計(jì)算理論聚合酶鏈反應(yīng)結(jié)果。莆田實(shí)時(shí)PCR檢測(cè)技術(shù)研究方案
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則復(fù)制成同樣的兩分子拷貝。在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過(guò)溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計(jì)引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。但是,DNA聚合酶在高溫時(shí)會(huì)失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價(jià)格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個(gè)循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡(jiǎn)捷、同時(shí)也降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。莆田實(shí)時(shí)PCR檢測(cè)技術(shù)研究方案
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