杭州實時定量PCR應用

Real-time PCR原理：基于探針的化學法，Real-time PCR應用一個或多個熒光標記的寡核苷酸探針檢測PCR擴增產物；依賴熒光能量共振傳遞（FRET）檢測特異性擴增產物，單單檢測特異性擴增產物，DNA及RNA定量；基因表達驗證；等位基因鑒別；SNP分型；病原體和病毒檢測；多重PCR，探針和目標片段的特異性結合產生熒光信號，因此減少了背景熒光和假陽性；探針可標記不同波長的熒光基團，用于多重PCR反應。對于不同的靶序列需要合成不同的探針，原料成本較高。聚合酶鏈反應為這些技術提供了大量的純DNA，有時是單鏈的。杭州實時定量PCR應用

Real-time PCR相對定量中的標準曲線法如何進行：主要是相對定量標準品的制作，一般有三種方法：1、比較復雜的方法：質粒，采用Biotnt提供內參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物，對目的基因進行Real-time PCR實驗，得到PCR擴增產物；PCR擴增產物轉入質粒中，得到相對定量的標準品；2、一般采用的方法1：比較強的CDNA模板，3、一般采用的方法：PCR擴增產物，如果在方法2中找不到比較強的CDNA模板，則選用PCR產物作為相對定量的標準品也是可以的；需要注意的事項是：PCR產物濃度很高，而Real-time PCR的產物片段比較短，容易在稀釋的過程中造成PCR污染，要注意操作。南京實時PCR檢測技術原理熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現的，這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。

Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR：1）內參照法：在不同的PCR反應管中加入已定量的內標和引物，內標用基因工程方法合成。上游引物用熒光標記，下游引物不標記。在模板擴增的同時，內標也被擴增。在PCR產物中，由于內標與靶模板的長度不同，二者的擴增產物可用電泳或高效液相分離開來，分別測定其熒光強度，以內標為對照定量待檢測模板。2）競爭法：選擇由突變克隆產生的含有一個新內切位點的外源競爭性模板。在同一反應管中，待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增（其中一個引物為熒光標記）。

實時熒光定量PCR：實時熒光定量PCR技術有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點檢測的局限，實現了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強度，并記錄在電腦軟件之中，通過對每個樣品Ct值的計算，根據標準曲線獲得定量結果。因此，實時熒光定量PCR無需內標是建立在兩個基礎之上的：Ct值的重現性PCR循環(huán)在到達Ct值所在的循環(huán)數時，剛剛進入真正的指數擴增期（對數期），此時微小誤差尚未放大，因此Ct值的重現性極好，即同一模板不同時間擴增或同一時間不同管內擴增，得到的Ct值是恒定的。聚合酶鏈反應五要素：參加PCR反應的物質主要有五種即：引物、酶、dNTP、模板和緩沖液。

Real-time PCR鏈式反應：每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶，不但操作煩瑣，而且價格昂貴，制約了PCR技術的應用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現對于PCR的應用有里程碑的意義，該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活，不需要每個循環(huán)加酶，使PCR技術變得非常簡捷、同時也降低了成本，PCR技術得以大量應用，并逐步應用于臨床。多重連接依賴探針擴增允許用單個引物對擴增多個靶標，從而避免多重PCR的分辨率限制。引物的設計注意事項：1，注意引物設計好后的產物長度。Real-time PCR的較佳產物長度在150-250kb左右（書上說這樣可以增加熒光的敏感度，減少實驗誤差，但是我對這個說法持懷疑態(tài)度。產物長度越大，SYBR嵌入的越多，這樣才能夠保證之后的熒光值比較可信）。2，不同的管家基因擴增效率不同。所以在做整個實驗之前應該做一次檢測擴增效率的實驗。如果擴增效率相差太大，就不能使用delt，deltCt法來比較基因表達量的高低。為了很大限度地減少污染的可能性，調查人員應該為試劑制備、聚合酶鏈反應和產品分析預留單獨的房間。南京血液熒光定量PCR服務

Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析。杭州實時定量PCR應用

聚合酶鏈式反應的試驗污染：陽性對照，在建立PCR反應實驗室及一般的檢驗單位都應設有PCR陽性對照，它是PCR反應是否成功、產物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個重要的參考標志。陽性對照要選擇擴增度中等、重復性好，經各種鑒定是該產物的標本，如以重組質粒為陽性對照，其含量宜低不宜高（100個拷貝以下）。但陽性對照尤其是重組質粒及高濃度陽性標本，其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大。因而當某一PCR試劑經自己使用穩(wěn)定。杭州實時定量PCR應用

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