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Real-time PCR相對(duì)定量中的標(biāo)準(zhǔn)曲線法如何進(jìn)行:主要是相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)品的制作,一般有三種方法:1、比較復(fù)雜的方法:質(zhì)粒,采用Biotnt提供內(nèi)參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對(duì)目的基因進(jìn)行Real-time PCR實(shí)驗(yàn),得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;PCR擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)入質(zhì)粒中,得到相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品;2、一般采用的方法1:比較強(qiáng)的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,如果在方法2中找不到比較強(qiáng)的CDNA模板,則選用PCR產(chǎn)物作為相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品也是可以的;需要注意的事項(xiàng)是:PCR產(chǎn)物濃度很高,而Real-time PCR的產(chǎn)物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR污染,要注意操作。聚合酶鏈反應(yīng)非常敏感,有可能產(chǎn)生數(shù)百萬到數(shù)十億份特定產(chǎn)品的拷貝,用于測(cè)序、克隆和分析。淮安組織PCR檢測(cè)技術(shù)
Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進(jìn)行mRNA表達(dá)量的測(cè)定,采用染料法是比較經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測(cè),染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應(yīng)用于病毒RNA的檢測(cè);以及單位點(diǎn)突變(SNP);多基因的合并檢測(cè),探針法還可用于同一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)檢測(cè)目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測(cè)。Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡(jiǎn)稱Real-time PCR)是在定性PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù)。實(shí)時(shí)熒光定量在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,使每一個(gè)循環(huán)變得“可見”,之后通過Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進(jìn)行定量的方法。淮安組織PCR檢測(cè)技術(shù)像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯(cuò),這反過來會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)生的PCR片段發(fā)生突變。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)生物學(xué)研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎(chǔ)發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項(xiàng)應(yīng)用技術(shù)。自誕生后Real-time PCR技術(shù)持續(xù)發(fā)展,從簡(jiǎn)單的增擴(kuò)到整個(gè)PCR過程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對(duì)識(shí)別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個(gè)循環(huán)增擴(kuò)曲線的增長(zhǎng)。事實(shí)并非如此,早期的軟件不能在運(yùn)行期間提供可視化的增擴(kuò)曲線。主要是因?yàn)镾DS軟件采用整個(gè)平臺(tái)較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)循環(huán)。對(duì)某些設(shè)備來說,必須向分析軟件提供實(shí)時(shí)的數(shù)據(jù),有些設(shè)備則不需要。前一種設(shè)備允許軟件實(shí)時(shí)跟蹤每個(gè)加樣口的增擴(kuò)曲線,同時(shí)顯示在電腦屏幕上。
PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會(huì)加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過長(zhǎng)使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長(zhǎng)度在15~25時(shí)退火溫度。熱啟動(dòng)/冷完成聚合酶鏈反應(yīng)是通過新的雜合聚合酶實(shí)現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。多重連接依賴探針擴(kuò)增允許用單個(gè)引物對(duì)擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。
Real-time PCR原理:所謂實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。DNA結(jié)合染料法,應(yīng)用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測(cè)PCR過程中積累的擴(kuò)增產(chǎn)物。檢測(cè)所有雙鏈DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,包括非特異反應(yīng)產(chǎn)物,如引物二聚體??蓪?duì)任何雙鏈DNA進(jìn)行定量;不需要探針,因此減少了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及運(yùn)轉(zhuǎn)成本;適合于大量基因的分析;簡(jiǎn)單易用。實(shí)時(shí)熒光定量PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴(kuò)增過程中,通過熒光信號(hào),對(duì)PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。PCR可能是分子生物學(xué)中使用很較廣的技術(shù)。南通血液RT-PCR檢測(cè)技術(shù)網(wǎng)站
Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析?;窗步M織PCR檢測(cè)技術(shù)
引物的設(shè)計(jì)注意事項(xiàng):1,引物設(shè)計(jì)要跨內(nèi)含子,不能在一個(gè)外顯子上(我們的實(shí)驗(yàn)是以cDNA為模板來擴(kuò)增的,如果有DNA污染的話,因?yàn)镈NA上含有分子量很大的內(nèi)含子,不可能完成擴(kuò)增。這對(duì)我們消除整個(gè)實(shí)驗(yàn)的誤差起很大的作用)。2,引物設(shè)計(jì)的時(shí)候要盡可能設(shè)計(jì)在同一退火溫度,方便于以后同時(shí)擴(kuò)增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開做,浪費(fèi)模板,浪費(fèi)管家基因,所以每個(gè)實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)引物的時(shí)候要盡可能一致,這樣就不用每次查退火溫度,且對(duì)整個(gè)實(shí)驗(yàn)有利?;窗步M織PCR檢測(cè)技術(shù)
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