Real-time PCR實驗注意事項-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。3.有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室溫10min,然后用0.1%DEPC水沖洗,晾干。4.配制的溶液應盡可能的用0.1%DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經(jīng)0.22μm濾膜過濾除菌。5.操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。6.設置RNA操作專業(yè)使用實驗室,所有器械等應為專業(yè)使用。實時熒光定量PCR是一種采用外標準曲線定量的方法。廣州組織數(shù)字PCR方案
Real-time PCR探針法適用于:1、具有高適應性和可靠性,實驗結果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。2、適用于擴增序列專一的體系的檢測。3、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。4、靶基因的特異序列較短,無論怎樣較佳化引物設計條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴增,對特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動物病原體基因的檢測,畜禽產(chǎn)品的檢驗檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針法:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的螢光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告螢光基團和一個淬滅螢光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的螢光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告螢光基團和淬滅螢光基團分離,從而螢光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到螢光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個螢光分子形成,實現(xiàn)了螢光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。杭州實時PCR檢測技術研究方案聚合酶鏈反應允許快速生產(chǎn)短DN段,即使已知的引物序列不超過兩個。
Real-time PCR雙熒光標記探針設計原則:具體的其他要求可以具體聯(lián)系設計公司,拿到合成好的引物,需要先確認引物的性能??梢杂眠@對引物先擴增梯度稀釋后的標準品(標準品介紹見后續(xù)內容)。由不同梯度標準品的加量和其對應的Ct值,描繪出一條標準曲線。這里要注意根據(jù)標準曲線得到的參數(shù)是非常重要的。引物性能確認:1.決定系數(shù)R2大于0.98,越接近于1,結果越可靠。2.擴增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.檢測的靈敏度,必須確認,通常要求35個循環(huán)以內,一般可以得到比較好的定量結果,30個循環(huán)以內,沒有非特異性擴增產(chǎn)生。4.NTC是必須要確認的,通常要求30個循環(huán)內沒有引物二聚體產(chǎn)生。
Real-time PCR:使用Real-time PCR進行基因檢測,被普遍應用于病毒和病原菌檢測、轉基因食品檢測、遺傳病基因檢測等領域。一般首先需要利用專業(yè)使用的試劑盒從待檢樣品中提取其核酸(DNAorRNA),并經(jīng)過精制等復雜的操作(通常稱為前處理操作)之后才可以進行Real-time PCR。不易受反應阻害物的影響,使用時不需要進行復雜的前處理操作,單單需將待檢樣品直接加入到檢測試劑中即可開始檢測。通過使用本產(chǎn)品,可以在更短的時間內,簡便、低成本地進行Real-time PCR檢測。在PCR產(chǎn)物中,由于內標與靶模板的長度不同。
Real-time PCR與普通PCR的實驗目的不同,所以對引物的設計要求也不同。普通PCR的實驗目的只是為了獲得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴增,只要目標條帶清晰明亮,就可以通過切膠回收的方法回收目標條帶,之后進行后續(xù)的克隆、測序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進行擴增,只有這樣的擴增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準確,基于此,Real-time PCR對非特異性擴增和引物二聚體的存在有較嚴格的要求。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應得到解決。武漢分子生物學熒光PCR服務
Real-time PCR在實驗內參的設定主要為了用于靶RNA的定量。廣州組織數(shù)字PCR方案
聚合酶鏈式反應:因為PCR擴增了目的DNA區(qū)域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對于法醫(yī)檢定法,當時只有微量的DNA可作為證據(jù)。聚合酶鏈反應也可用于分析古代DNA那已經(jīng)有數(shù)萬年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應的技術已經(jīng)成功地應用于動物身上,例如四萬年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應或者實時聚合酶鏈反應不要與逆轉錄-聚合酶鏈反應方法混淆)允許估計樣品中存在的給定序列的量——這種技術通常用于定量確定基因表達的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測量每輪PCR擴增后DNA產(chǎn)物的積累。聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。廣州組織數(shù)字PCR方案
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