武漢細胞數(shù)字PCR服務

來源: 發(fā)布時間:2023-03-30

Real-time PCR原理:基于探針的化學法,Real-time PCR應用一個或多個熒光標記的寡核苷酸探針檢測PCR擴增產(chǎn)物;依賴熒光能量共振傳遞(FRET)檢測特異性擴增產(chǎn)物,單單檢測特異性擴增產(chǎn)物,DNA及RNA定量;基因表達驗證;等位基因鑒別;SNP分型;病原體和病毒檢測;多重PCR,探針和目標片段的特異性結合產(chǎn)生熒光信號,因此減少了背景熒光和假陽性;探針可標記不同波長的熒光基團,用于多重PCR反應。對于不同的靶序列需要合成不同的探針,原料成本較高。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應得到解決。武漢細胞數(shù)字PCR服務

武漢細胞數(shù)字PCR服務,Real-timePCR技術服務

所謂real-timeQ-PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。在real-time技術的發(fā)展過程中,兩個重要的發(fā)現(xiàn)起著關鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標記探針的運用使在一密閉的反應管中能實時地監(jiān)測反應全過程。這兩個發(fā)現(xiàn)的結合以及相應的儀器和試劑的商品化發(fā)展導致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運用。珠海細胞Real-time PCR原理實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準確的方法。

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Real-time PCR雙熒光標記探針設計原則:具體的其他要求可以具體聯(lián)系設計公司,拿到合成好的引物,需要先確認引物的性能。可以用這對引物先擴增梯度稀釋后的標準品(標準品介紹見后續(xù)內(nèi)容)。由不同梯度標準品的加量和其對應的Ct值,描繪出一條標準曲線。這里要注意根據(jù)標準曲線得到的參數(shù)是非常重要的。引物性能確認:1.決定系數(shù)R2大于0.98,越接近于1,結果越可靠。2.擴增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.檢測的靈敏度,必須確認,通常要求35個循環(huán)以內(nèi),一般可以得到比較好的定量結果,30個循環(huán)以內(nèi),沒有非特異性擴增產(chǎn)生。4.NTC是必須要確認的,通常要求30個循環(huán)內(nèi)沒有引物二聚體產(chǎn)生。

聚合酶鏈式反應生物學研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項應用技術。自誕生后Real-time PCR技術持續(xù)發(fā)展,從簡單的增擴到整個PCR過程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環(huán)增擴曲線的增長。事實并非如此,早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個單獨的反應循環(huán)。對某些設備來說,必須向分析軟件提供實時的數(shù)據(jù),有些設備則不需要。前一種設備允許軟件實時跟蹤每個加樣口的增擴曲線,同時顯示在電腦屏幕上。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段。

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聚合酶鏈式反應準備:PCR引物設計,PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。引物設計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。聚合酶鏈式反應準備:引物內(nèi)部不應出現(xiàn)互補序列。上海骨頭定量PCR應用

PCR可能是分子生物學中使用很較廣的技術。武漢細胞數(shù)字PCR服務

為了便于對所檢測樣本進行比較,在real-timeQ-PCR反應的指數(shù)期,首先需設定一定熒光信號的域值,一般這個域值(threshold)是以PCR反應的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號(baseline),熒光域值的缺省設置是3~15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認為是真正的信號,它可用于定義樣本的域值循環(huán)數(shù)(Ct)。Ct值的含義是:每個反應管內(nèi)的熒光信號達到設定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明,每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標準品可作出標準曲線,因此只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數(shù)。武漢細胞數(shù)字PCR服務

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