廈門微量熒光定量PCR方案

Real-time PCR：實(shí)時(shí)熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準(zhǔn)確的方法。如果用于RNA檢測(cè)，這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)PCR即（Real-timeRT-PCR）是實(shí)時(shí)PCR法，它是指對(duì)DNA或經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)入（RT-PCR）的RNA通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)DNA的放大過(guò)程，在擴(kuò)增的指數(shù)增長(zhǎng)期就測(cè)量擴(kuò)增產(chǎn)物，因?yàn)閿U(kuò)增指數(shù)增長(zhǎng)期測(cè)量值與特異DNA（RNA）起始量存在相關(guān)性，從而實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測(cè)量和鑒別非常微量的特異性核酸，從而可通過(guò)監(jiān)測(cè)CT值而實(shí)現(xiàn)對(duì)原始目標(biāo)基因的含量定量。實(shí)時(shí)熒光定量PCR法較大的優(yōu)點(diǎn)是克服了終點(diǎn)PCR法進(jìn)入平臺(tái)期或叫飽和期后定量的較大誤差，實(shí)現(xiàn)DNA/RNA的精確定量。該技術(shù)不單單實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA/RNA模板的定量，而且具有靈敏度和特異性高、能實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng)、自動(dòng)化程度高、無(wú)污染、實(shí)時(shí)和準(zhǔn)確等特點(diǎn)，該技術(shù)在醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)及臨床醫(yī)學(xué)研究方面有著重要的意義?；谔结樀幕瘜W(xué)法，Real-time PCR應(yīng)用一個(gè)或多個(gè)熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。廈門微量熒光定量PCR方案

Real-time PCR原理：基于探針的化學(xué)法，Real-time PCR應(yīng)用一個(gè)或多個(gè)熒光標(biāo)記的寡核苷酸探針檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物；依賴熒光能量共振傳遞（FRET）檢測(cè)特異性擴(kuò)增產(chǎn)物，單單檢測(cè)特異性擴(kuò)增產(chǎn)物，DNA及RNA定量；基因表達(dá)驗(yàn)證；等位基因鑒別；SNP分型；病原體和病毒檢測(cè)；多重PCR，探針和目標(biāo)片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號(hào)，因此減少了背景熒光和假陽(yáng)性；探針可標(biāo)記不同波長(zhǎng)的熒光基團(tuán)，用于多重PCR反應(yīng)。對(duì)于不同的靶序列需要合成不同的探針，原料成本較高。廈門微量熒光定量PCR方案在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物，內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。

實(shí)時(shí)熒光定量PCR：實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點(diǎn)檢測(cè)的局限，實(shí)現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測(cè)一次熒光信號(hào)的強(qiáng)度，并記錄在電腦軟件之中，通過(guò)對(duì)每個(gè)樣品Ct值的計(jì)算，根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得定量結(jié)果。因此，實(shí)時(shí)熒光定量PCR無(wú)需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個(gè)基礎(chǔ)之上的：Ct值的重現(xiàn)性PCR循環(huán)在到達(dá)Ct值所在的循環(huán)數(shù)時(shí)，剛剛進(jìn)入真正的指數(shù)擴(kuò)增期（對(duì)數(shù)期），此時(shí)微小誤差尚未放大，因此Ct值的重現(xiàn)性極好，即同一模板不同時(shí)間擴(kuò)增或同一時(shí)間不同管內(nèi)擴(kuò)增，得到的Ct值是恒定的。

Real-time PCR相對(duì)定量中的標(biāo)準(zhǔn)曲線法如何進(jìn)行：主要是相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)品的制作，一般有三種方法：1、比較復(fù)雜的方法：質(zhì)粒，采用Biotnt提供內(nèi)參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物，對(duì)目的基因進(jìn)行Real-time PCR實(shí)驗(yàn)，得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物；PCR擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)入質(zhì)粒中，得到相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品；2、一般采用的方法1：比較強(qiáng)的CDNA模板，3、一般采用的方法：PCR擴(kuò)增產(chǎn)物，如果在方法2中找不到比較強(qiáng)的CDNA模板，則選用PCR產(chǎn)物作為相對(duì)定量的標(biāo)準(zhǔn)品也是可以的；需要注意的事項(xiàng)是：PCR產(chǎn)物濃度很高，而Real-time PCR的產(chǎn)物片段比較短，容易在稀釋的過(guò)程中造成PCR污染，要注意操作。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。

聚合酶鏈反應(yīng)注意事項(xiàng)：在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要防止RNA的降解，保持RNA的完整性。在總RNA的提取過(guò)程中，注意避免mRNA的斷裂；為了防止非特異性擴(kuò)增，必須設(shè)陰性對(duì)照；內(nèi)參的設(shè)定主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD（甘油醛-3-磷酸脫氫酶）、β-Actin（β-肌動(dòng)蛋白）等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差；PCR不能進(jìn)入平臺(tái)期，出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長(zhǎng)度、序列、二級(jí)結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對(duì)于每一個(gè)目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺(tái)效應(yīng)的循環(huán)數(shù)，均應(yīng)通過(guò)單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來(lái)確定；防止DNA的污染：采用DNA酶處理RNA；在可能的情況下，將PCR引物置于基因的不同外顯子，以消除基因和mRNA的共線性。聚合酶鏈反應(yīng)可以選擇這些突變來(lái)理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的，并改變或改善蛋白質(zhì)功能。聚合酶鏈反應(yīng)允許快速生產(chǎn)短DN段，即使已知的引物序列不超過(guò)兩個(gè)。廣州分子生物學(xué)數(shù)字PCR原理

Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)內(nèi)參的設(shè)定主要為了用于靶RNA的定量。廈門微量熒光定量PCR方案

Real-time PCR探針?lè)ㄟm用于：1、具有高適應(yīng)性和可靠性，實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定重複性好，特異性更高。2、適用于擴(kuò)增序列專一的體系的檢測(cè)。3、樣品中靶基因含量過(guò)低的定量PCR檢測(cè)。4、靶基因的特異序列較短，無(wú)論怎樣較佳化引物設(shè)計(jì)條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列，在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增，對(duì)特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動(dòng)物病原體基因的檢測(cè),畜禽產(chǎn)品的檢驗(yàn)檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針?lè)?PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的螢光探針，該探針為一寡核苷酸，兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告螢光基團(tuán)和一個(gè)淬滅螢光基團(tuán)。探針完整時(shí)，報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的螢光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收；PCR擴(kuò)增時(shí)，Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解，使報(bào)告螢光基團(tuán)和淬滅螢光基團(tuán)分離，從而螢光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到螢光信號(hào)，即每擴(kuò)增一條DNA鏈，就有一個(gè)螢光分子形成，實(shí)現(xiàn)了螢光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。廈門微量熒光定量PCR方案

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