我國工廠養(yǎng)殖目前受水處理成本的壓力，仍主要以流水養(yǎng)殖、半封閉循環(huán)水養(yǎng)殖為主，真正意義上的全封閉循環(huán)水養(yǎng)殖企業(yè)較少。流水養(yǎng)殖和半封閉養(yǎng)殖方式產(chǎn)量低（單位水體產(chǎn)量10—15千克/米2·年）、耗能大、效率低，與先進國家技術(shù)密集型的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)相比，在系統(tǒng)的循環(huán)水率、系統(tǒng)輔助水體的比率等關(guān)鍵性能方面基本接近國際水平，在設(shè)備、工藝、產(chǎn)量（先進技術(shù)的產(chǎn)量達100千克/米2·年以上）和效益等方面，以及生物凈化系統(tǒng)的構(gòu)建、凈化效率和穩(wěn)定性、系統(tǒng)集成度、系統(tǒng)穩(wěn)定性等方面仍存在著一定的差距。
在目前的發(fā)展水平下，循環(huán)水養(yǎng)殖模式較高的準(zhǔn)入門檻使得循環(huán)水養(yǎng)殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養(yǎng)殖品種有限，限制了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的發(fā)展。近些年來，經(jīng)過專家學(xué)者和眾多的養(yǎng)殖企業(yè)的不斷探索，國內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)既是一個復(fù)雜的系統(tǒng)工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養(yǎng)殖品種的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，只要不出現(xiàn)明顯的設(shè)計漏洞，系統(tǒng)運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統(tǒng)管理技術(shù)和養(yǎng)殖技術(shù)來解決。
我國苗種繁育過程的全人工控制技術(shù)尚處于起步階段，低營養(yǎng)條件下的生物膜培養(yǎng)技術(shù)、水質(zhì)的智能化控制技術(shù)、不同特性魚卵孵化設(shè)施技術(shù)、繁育過程智能化判別技術(shù)等需要突破，繁育生態(tài)環(huán)境人工控制技術(shù)需要優(yōu)化和集成。有必要針對我國大宗養(yǎng)殖產(chǎn)品和一些名特優(yōu)品種的苗種繁育要求，應(yīng)用現(xiàn)代水環(huán)境控制技術(shù)和孵化繁育生境模擬技術(shù)，構(gòu)建特定的設(shè)備系統(tǒng)，形成完善的養(yǎng)殖生產(chǎn)工藝，達到水環(huán)境有效控制、孵化過程有效調(diào)控、節(jié)能節(jié)水以及反季節(jié)工業(yè)化生產(chǎn)的目的。