在目前的發(fā)展水平下，循環(huán)水養(yǎng)殖模式較高的準(zhǔn)入門檻使得循環(huán)水養(yǎng)殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養(yǎng)殖品種有限，限制了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的發(fā)展。近些年來，經(jīng)過專家學(xué)者和眾多的養(yǎng)殖企業(yè)的不斷探索，國(guó)內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)既是一個(gè)復(fù)雜的系統(tǒng)工程，又是一個(gè)矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養(yǎng)殖品種的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，只要不出現(xiàn)明顯的設(shè)計(jì)漏洞，系統(tǒng)運(yùn)行過程中遇到的很多問題，可以通過系統(tǒng)管理技術(shù)和養(yǎng)殖技術(shù)來解決。
生化模式凈水主要是靠硝化細(xì)菌，硝化細(xì)菌從無到有這個(gè)過程俗稱掛膜。硝化細(xì)菌掛膜需要濾材（細(xì)菌屋）；硝化細(xì)菌屬于好氧細(xì)菌，因此需要氧氣；硝化細(xì)菌繁殖還需要養(yǎng)分，也就是魚糞。再滿足上訴三個(gè)情況下，保持25度水溫，硝化細(xì)菌從無到有需要將近35天，15度水溫情況下需要50天或者更久，這個(gè)過程叫冷啟動(dòng)。想快速啟動(dòng)，可以使用液體硝化細(xì)菌，或者添加一些其他已經(jīng)掛膜的濾材進(jìn)來進(jìn)行引菌，這個(gè)過程叫熱啟動(dòng)。海水系統(tǒng)應(yīng)為高鹽度的問題，自然掛膜時(shí)間比淡水系統(tǒng)要長(zhǎng)一倍以上，時(shí)間也隨鹽度升高而延長(zhǎng)。
在低鹽度或淡水中養(yǎng)殖凡納濱對(duì)蝦時(shí)，必須對(duì)蝦苗進(jìn)行淡水馴化。在育苗室淡化速度每日鹽度降低不超過5，降至5時(shí)便可直接向微鹽池塘中放苗。在淡水池養(yǎng)殖，應(yīng)選擇在鹽度1以下水中穩(wěn)定培育3天以上的蝦苗，亦可先向池塘內(nèi)加入20～30厘米的淡水，再用出鹽前的鹵水或海水素（精）調(diào)節(jié)至適宜的鹽度放養(yǎng)蝦苗，經(jīng)數(shù)日暫養(yǎng)后，再逐日加入淡水。除直接放養(yǎng)外，尚可對(duì)幼小的蝦苗進(jìn)行中間培育，其好處是放養(yǎng)大規(guī)格蝦苗的成活率較穩(wěn)定，便于養(yǎng)成期的管理，而且可以延長(zhǎng)養(yǎng)殖期，在露天池尚達(dá)不到放養(yǎng)水溫時(shí)，可先將蝦苗放在有塑料大棚或其它升溫條件的池內(nèi)暫養(yǎng)一個(gè)時(shí)期，待露天池水溫上升后再分池養(yǎng)殖以延長(zhǎng)養(yǎng)殖期。中間培育的放苗密度可是養(yǎng)殖池的3～5倍。