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來源: 發(fā)布時間:2021-11-01

PCR實驗技術(shù)中的反向PCR(InversePCR)介紹:反向PCR起初設(shè)計用于確定臨近未知區(qū)域的序列。反向PCR有助于研究一個基因的啟動子序列;致*染色體重排如基因融合、異位或轉(zhuǎn)移;及病毒基因的整合。之所以稱為反向PCR,是因為引物設(shè)計用于向兩邊延伸而不像常規(guī)PCR中朝著彼此延伸。如今,反向PCR常用于定點突變,復(fù)制一個具有預(yù)期突變的目的質(zhì)粒。在研究基因組DNA未知序列的傳統(tǒng)實驗流程中,限制性內(nèi)切酶消化和連接先于反向PCR,接著對PCR擴增子進行測序。對于gDNA消化,需選擇一種限制性內(nèi)切酶進行酶切以獲得合適長度可自連的片段。同時,所選擇的內(nèi)切酶不應(yīng)該切割已知序列,所以連接發(fā)生于側(cè)翼的未知序列之間。使用低濃度的酶切DNA的片段以助于片段自連而非多個片段連接。片段自連完成后,通過反向PCR擴增DNA的位置區(qū)域。獲得的擴增子兩端包含一部分已知序列。之后通過測序以鑒定臨近已知序列的未知區(qū)域。pcr檢測實驗有哪些分類?甘肅組織pcr哪家好

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PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程,DNA的半保留復(fù)制是生物進化和傳代的重要途徑。其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備;②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;③引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈,重復(fù)循環(huán)變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍陜西細胞pcr要多久英瀚斯生物,專業(yè)儀器,豐富經(jīng)驗,高質(zhì)量pcr。

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PCR引物設(shè)計的原則PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。(1)引物設(shè)計的基本原則引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應(yīng)存在互補序列,尤其是避免3′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個堿基,應(yīng)嚴格要求配對,比較好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。

PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR一步法和兩步法的優(yōu)缺點介紹:一步法:利用同一緩沖液,在同一體系中加入逆轉(zhuǎn)錄酶、引物、Taq酶、4種dNTP直接進行mRNA反轉(zhuǎn)錄與PCR擴增。發(fā)現(xiàn)Taq酶不僅具有DNA多聚酶的作用,而且具有反轉(zhuǎn)錄酶活性,可利用其雙重作用在同一體系中直接以mRNA為模板進行反轉(zhuǎn)錄和其后PCR擴增,從而使mRNA的PCR步驟更為簡化。所需樣品量減少到比較低限度,臨床小樣品的檢測非常有利。用一步法擴增可檢測出總RNA中小于1ng的低豐度mRNA.該法可用于低豐度mRNA的cDNA文庫的構(gòu)建及特異cDNA的克隆,并有可能與Taq酶的測序技術(shù)相組合,使得自動反轉(zhuǎn)錄、基因擴增與基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的測序在單管中進行。兩步法:由于單管反應(yīng)時RT和PCR都不能在比較好條件下進行并且容易相互干擾,常只適宜用基因特異引物擴增較短的基因,及定量PCR.兩步法則是將RT和PCR分別進行,這樣使得兩個反應(yīng)充分發(fā)揮各自的特點,更為靈活而且嚴謹,適合那些GC含量、二級結(jié)構(gòu)嚴重的模板或者是未知模板,以及多個基因的RT-PCR。pcr儀的使用說明是什么?

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PCR實驗技術(shù)中的連接酶鏈反應(yīng)(Ligasechainreaction,LCR)介紹:連接酶鏈反應(yīng)(Ligasechainreaction,LCR),是一種新的DNA體外擴增和檢測技術(shù),主要用于點突變的研究及靶基因的擴增。連接酶鏈反應(yīng)是Backman1997年為檢出靶基因序列中的點突變而設(shè)計發(fā)明,并申報了**。1988年Landegren也進行了該項研究。1988年Backman等又因分離熱穩(wěn)定的連接酶,1991年Backman和Barany分別用耐熱DNA連接酶進行了LCR試驗。耐熱DNA連接酶可以在熱循環(huán)中保持活性,提高連接反應(yīng)的特異性,排除了背景擴增和免除了不斷補充酶的繁瑣程序。如何挑選pcr檢測試劑盒?陜西細胞pcr哪家好

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PCR實驗技術(shù)中的多重PCR(MultiplexPCR))介紹:多重PCR可實現(xiàn)在同一反應(yīng)管中同時擴增多個不同的片段。多重PCR不僅意味著節(jié)約時間、試劑和樣本,同時使得多個擴增子進行同時比較成為可能。當一個反應(yīng)管中存在多個引物對時,如在多重PCR中,非特異性擴增和擴增效率的降低是較關(guān)注的問題,因為反應(yīng)的優(yōu)化不可能針對所有的引物對和片段。因此,引物的設(shè)計至關(guān)重要,以減少錯配引起的非特異性擴增。引物序列對于目標片段應(yīng)該是獨特的,且所有引物的Tm值差異應(yīng)在5℃內(nèi)。在進行多重PCR前,每個引物對應(yīng)在單個反應(yīng)中驗證其特異性和擴增效率。而且,不同大小的擴增子應(yīng)在凝膠電泳中可區(qū)分開,以便鑒定。除了引物設(shè)計和擴增子大小,熱啟動DNA聚合酶和特殊優(yōu)化的PCR緩沖液對于多重PCR也是必需的,它們可有助于擴增的成功率和擴增的特異性。甘肅組織pcr哪家好

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