福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-01-20

高通量篩選初是伴隨組合化學(xué)而產(chǎn)生的一種藥物篩選方式。1990年代末,組合化學(xué)的出現(xiàn)改變了人類獲取新化合物的方式,人們可以通過較少的步驟在短時(shí)間內(nèi)同時(shí)合成大量化合物,在這樣的背景下高通量篩選的技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。高通量篩選技術(shù)可以在短時(shí)間內(nèi)對(duì)大量候選化合物完成篩選,經(jīng)過發(fā)展,已經(jīng)成為比較成熟的技術(shù),不僅應(yīng)用于對(duì)組合化學(xué)庫的化合物篩選,還更多地應(yīng)用于對(duì)現(xiàn)有化合物庫的篩選。世界各大藥物生產(chǎn)商都建立有自己的化合物庫和高通量篩選機(jī)構(gòu),對(duì)有潛力形成藥物的化合物進(jìn)行篦梳式的篩選。菌種高通量篩選實(shí)驗(yàn)。福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)

福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn),高通量篩選

高通量篩選(Highthroughputscreening,HTS)技術(shù)包括機(jī)器人技術(shù)、液體處理器、數(shù)據(jù)處理、相當(dāng)多的軟件和敏感的檢測(cè)系統(tǒng)。它是一種藥物發(fā)現(xiàn)過程,可以使生化或細(xì)胞事件能夠重復(fù)和快速測(cè)試化合物數(shù)十萬次。HTS可根據(jù)待測(cè)樣品的種類大致分為細(xì)胞水平篩選和分子水平篩選兩類。細(xì)胞水平篩選是在細(xì)胞個(gè)體水平上完成的檢測(cè),由于含有諸如信號(hào)傳導(dǎo)、物質(zhì)代謝等關(guān)于細(xì)胞生命活動(dòng)的信息,因此可以省去體外篩選中的許多步驟。下面將圍繞細(xì)胞水平篩選介紹幾種常用的檢測(cè)方法:離子通道檢測(cè)、報(bào)告基因檢測(cè)和細(xì)胞增殖檢測(cè)。青海酶的高通量篩選細(xì)胞水平高通量篩選。

福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn),高通量篩選

高通量的抗體制備,篩選技術(shù)不僅可以的提高工作效率,而且可能提高雙特異抗體篩選的成功率。接下來介紹三類雙特異抗體高通量篩選技術(shù),包括雙特異抗體的制備,雙特異抗體的質(zhì)量分析等。為了能夠篩選到針對(duì)自身性免疫疾病如SLE(系統(tǒng)性紅斑狼瘡)的雙特異抗體,作者對(duì)B細(xì)胞表面的23個(gè)靶點(diǎn)進(jìn)行單克隆抗體的篩選,每個(gè)靶點(diǎn)有1-8個(gè)候選的單克隆抗體,并且這些抗體沒有進(jìn)行過親合力或者表位的預(yù)先篩選。雙特異抗體是為了模擬雙抗結(jié)構(gòu)而建立的平臺(tái),該平臺(tái)中,雙抗包括兩個(gè)部分Fab-X (Fab-scFv) 和 Fab-Y (Fab-peptide)。為了能夠篩選到針對(duì)自身性免疫疾病如SLE(系統(tǒng)性紅斑狼瘡)的雙特異抗體,作者對(duì)B細(xì)胞表面的23個(gè)靶點(diǎn)進(jìn)行單克隆抗體的篩選,每個(gè)靶點(diǎn)有1-8個(gè)候選的單克隆抗體,并且這些抗體沒有進(jìn)行過親合力或者表位的預(yù)先篩選。

開發(fā)一種新藥的過程可能是漫長、復(fù)雜和不確定的,但從社會(huì)、科學(xué)和經(jīng)濟(jì)的角度來看,它也可能是高回報(bào)的。高通量篩選(HTS)已經(jīng)成為藥物發(fā)現(xiàn)的主要工具。,向大家介紹目前用于靶標(biāo)確認(rèn)的幾種HTS方法,主要分為兩大類:生化水平和細(xì)胞水平。生化水平分析包括比率熒光法(FA/FP)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)、時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)等;細(xì)胞水平的分析包括細(xì)胞活力、報(bào)告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。生化篩選利用純化的目標(biāo)蛋白,在體外測(cè)定配體的結(jié)合或酶活性的抑制。這些檢測(cè)通常在384孔板中以競(jìng)爭(zhēng)的形式進(jìn)行,其中所研究的化合物必須取代已知的配體或底物。熒光法由于其使用簡(jiǎn)便、靈敏度高和靈活性強(qiáng)等特點(diǎn),廣受科研人員的歡迎,主要有比率熒光法(FA/FP)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)、時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)。高通量篩選技術(shù)的方法有哪些。

福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn),高通量篩選

為了避免頻繁命中化合物對(duì)實(shí)驗(yàn)干擾,許多實(shí)驗(yàn)方法,例如采用qHTS、ADP-Glo等更先進(jìn)高通量篩選方法,或者采用交互實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等用于增強(qiáng)篩選結(jié)果可行度。此外,隨著更多晶體結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)分享和生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)庫整理,頻繁命中化合物的探索變得更加可行。為人熟知且使用的就是PAINS(Pan-assay interference compounds)篩選規(guī)則。這是Baell等人在2010年基于六個(gè)不同靶點(diǎn)高通量篩選實(shí)驗(yàn)結(jié)果,并將其中頻繁出現(xiàn)(≥4次)的化合物和相關(guān)結(jié)構(gòu)總結(jié)為包含480個(gè)子結(jié)構(gòu)的篩選規(guī)則。但這類規(guī)則主要針對(duì)的是化學(xué)易反應(yīng)化合物,且PAINS規(guī)則本身也有很大局限性,因此,頻繁命中化合物相關(guān)篩選預(yù)測(cè)工具的開發(fā)仍然是現(xiàn)今研究熱點(diǎn)。在2017年,一篇由九名美國化學(xué)學(xué)會(huì)雜志主編聯(lián)名發(fā)表的文章“The Ecstasy and Agony of Assay Interference Compounds”中強(qiáng)調(diào)了實(shí)驗(yàn)干擾引起的假陽性化合物的危害,告誡研究人員對(duì)篩選得出的陽性結(jié)果真實(shí)性需要反復(fù)確認(rèn),對(duì)潛在的假陽性結(jié)果需要提高警惕。為了更深入的了解頻繁命中化合物和相關(guān)機(jī)制。如何實(shí)現(xiàn)快速高通量篩選。天津高通量篩選法

高通量篩選研究現(xiàn)狀。福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)

微生物菌種的改造是現(xiàn)代微生物發(fā)酵行業(yè)中,提高其工業(yè)化生產(chǎn)性能,提高酶和菌的性能非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)。而快速高效的高通量篩選方法的建立又是菌株改造中非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)。傳統(tǒng)的微生物快速篩選方法,瓊脂平板法可分為表型活性篩選和表型生長選擇。表型活性篩選利用菌落周圍產(chǎn)生的水解圈、顏色圈或熒光產(chǎn)物等進(jìn)行酶活或目標(biāo)產(chǎn)物篩選;表型生長選擇根據(jù)細(xì)胞對(duì)或其他有害物質(zhì)的抗性或營養(yǎng)缺陷型互補(bǔ),在選擇培養(yǎng)基中依據(jù)生長情況進(jìn)行篩選。瓊脂平板篩選法基于透明圈、顏色圈的瓊脂平板活性篩選或基于營養(yǎng)缺陷型或抗性的瓊脂平板生長選擇可作為簡(jiǎn)單易行的初篩方法,用于排除大量無活性和極低活性的突變體。但并不是所有的改造目標(biāo)都能建立瓊脂平板篩選法。瓊脂平板篩選法,是一種簡(jiǎn)單直接的篩選方法,已用于多種水解酶(如脂肪酶、酯酶、蛋白酶)和氧化還原酶(如漆酶)等突變庫的初步篩選中。福建高通量篩選相關(guān)的實(shí)驗(yàn)

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