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在PCR實(shí)驗(yàn)中,除了BsuDNAPolymerase,還有幾種聚合酶適合高溫?cái)U(kuò)增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,來(lái)源于Thermusaquaticus,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,可以承受PCR的熱變性步驟,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來(lái)源于Pyrococcusfuriosus,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,提供校正功能,適用于對(duì)PCR保真性要求較高的實(shí)驗(yàn),如基因篩選、克隆表達(dá)、突變檢測(cè)、定點(diǎn)突變等。3.**VentDNAPolymerase**:來(lái)源于Litoralis棲熱球菌,具有3'→5'外切酶活性,可以去除錯(cuò)配的堿基,具有校對(duì)功能,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍。4.**KODDNAPolymerase**:來(lái)自Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性比PfuDNAPolymerase更高,優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴(kuò)增速度達(dá)到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**:來(lái)源于Bacillusstearothermophilus,具有3'到5'外切割活性,適用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),可在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。Probe qPCR Mix (2×)通常含有熱啟動(dòng)DNA聚合酶,這種聚合酶在高溫下激發(fā),可以減少非特異性擴(kuò)增 。Recombinant Human IL-1RA
BsuDNAPolymerase(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶)在PCR中的應(yīng)用具有多個(gè)優(yōu)勢(shì),以下是一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**鏈置換活性**:BsuDNAPolymerase具有很強(qiáng)的鏈置換活性,這使得它非常適合于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)。在這些技術(shù)中,BsuDNAPolymerase可以快速、高效、特異性地?cái)U(kuò)增模板,在10到30分鐘內(nèi)將痕量的核酸模板(低至單拷貝)擴(kuò)增至可以檢出的水平。2.**高溫穩(wěn)定性**:BsuDNAPolymerase在高溫下保持活性,這使得它在一些需要高溫反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)條件下表現(xiàn)出色。3.**高靈敏度和特異性**:BsuDNAPolymerase在等溫?cái)U(kuò)增中展現(xiàn)出高靈敏度,能夠?qū)⑽⒘亢怂崮0鍞U(kuò)增到可檢測(cè)水平。同時(shí),它也具有高特異性,減少了非特異性擴(kuò)增的風(fēng)險(xiǎn)。4.**簡(jiǎn)化的樣品處理**:BsuDNAPolymerase可以直接對(duì)復(fù)雜樣品進(jìn)行擴(kuò)增,無(wú)需事先進(jìn)行復(fù)雜的核酸純化和提取步驟,節(jié)省了時(shí)間和成本。5.**可擴(kuò)增DNA和RNA**:BsuDNAPolymerase不僅可以擴(kuò)增DNA,還可以直接擴(kuò)增RNA,省去了額外的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(cDNA合成)步驟,這對(duì)于RNA的檢測(cè)和分析更加方便快捷。6.**無(wú)核酸外切酶和RNase殘留**:BsuDNAPolymerase在生產(chǎn)過(guò)程中確保無(wú)核酸外切酶、切口酶及RNase殘留,這有助于提高實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。PreScission Protease(PSP) 重組PreScission蛋白酶在cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)中,Ultra-Long Master Mix 可以用來(lái)擴(kuò)增5'和3'末端的長(zhǎng)片段cDNA。
在PCR實(shí)驗(yàn)中,為了避免引物與已知序列的交叉反應(yīng),從而確保實(shí)驗(yàn)的特異性,以下是一些關(guān)鍵的引物設(shè)計(jì)原則和策略:1.**選擇高保守性區(qū)域**:引物比較好設(shè)計(jì)在模板cDNA的保守區(qū)內(nèi),這樣可以確保引物與目標(biāo)序列的特異性結(jié)合。通過(guò)比較不同物種的同一基因序列,可以確定基因的保守區(qū)。2.**避免引物與非目標(biāo)序列的同源性**:設(shè)計(jì)引物時(shí),應(yīng)避免與基因組中的重復(fù)序列、假基因或高同源性區(qū)域設(shè)計(jì)引物??梢酝ㄟ^(guò)BLAST等工具對(duì)引物進(jìn)行同源性分析,確保引物只與目標(biāo)序列結(jié)合。3.**引物長(zhǎng)度和GC含量**:引物長(zhǎng)度一般在15-30堿基之間,常用的是18-27bp。GC含量一般為40%-60%,以45-55%為宜。過(guò)高或過(guò)低的GC含量都不利于引發(fā)反應(yīng),上下游引物的GC含量和Tm值應(yīng)保持接近。4.**避免引物的3'端錯(cuò)配**:引物3'端的堿基應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),特別是倒數(shù)第二個(gè)堿基,以避免因末端堿基不配對(duì)而導(dǎo)致PCR失敗。引物3'端比較好不要選擇A,比較好選擇T,因?yàn)楫?dāng)末位鏈為T(mén)時(shí),錯(cuò)配的引發(fā)效率降低。5.**避免引物自身及引物之間的互補(bǔ)序列**:引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,否則引物自身會(huì)折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu),影響引物與模板的復(fù)性結(jié)合。前后引物之間也不應(yīng)具有互補(bǔ)性,尤其應(yīng)避免3'端的互補(bǔ)重疊以防止引物二聚體的形成。
提取的病毒核酸可以直接用于多種實(shí)驗(yàn),主要包括:1.**實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)**:這是一種常用的技術(shù),可以對(duì)病毒核酸進(jìn)行定量檢測(cè)。它通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR過(guò)程中的熒光信號(hào)來(lái)確定病毒核酸的數(shù)量。例如,病毒核酸檢測(cè)就是基于此技術(shù),通過(guò)設(shè)計(jì)特異性引物和探針,對(duì)病毒的靶基因進(jìn)行定性檢測(cè)。2.**逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)**:這項(xiàng)技術(shù)用于檢測(cè)RNA病毒,通過(guò)將病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以檢測(cè)病毒的存在。RT-PCR技術(shù)靈敏而且用途廣,可以用于檢測(cè)細(xì)胞、組織中RNA病毒的含量。3.**等溫?cái)U(kuò)增法**:包括環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和切口延伸等溫?cái)U(kuò)增(NEAR),這些方法在恒溫條件下進(jìn)行,無(wú)需復(fù)雜的設(shè)備,適用于快速、現(xiàn)場(chǎng)的病毒核酸檢測(cè)。4.**數(shù)字PCR(dPCR)**:這是一種高度靈敏的技術(shù),可以對(duì)病毒核酸進(jìn)行定量。它通過(guò)將樣本分配到成千上萬(wàn)的微小反應(yīng)室中,每個(gè)反應(yīng)室單獨(dú)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒核酸的精確計(jì)數(shù)。5.**核酸雜交技術(shù)**:如熒光原位雜交(FISH),可以用于檢測(cè)特定病毒核酸序列在細(xì)胞或組織中的存在和定位。泛素分子可以通過(guò)其內(nèi)部的賴氨酸殘基與其他泛素分子形成多聚泛素鏈,這一步驟通常由E3酶催化。
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫(kù)中,牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長(zhǎng)的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同,需要靈活運(yùn)用,并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。
Multiplex Probe qPCR Mix 已預(yù)混了低濃度ROX參比染料,適用于需要低濃度ROX校正的熒光定量PCR儀 。Recombinant Cynomolgus IL-9 Protein,His Tag
泛素蛋白是一種在真核細(xì)胞中存在的小分子蛋白質(zhì),由76個(gè)氨基酸殘基組成,具有高度的保守性。Recombinant Human IL-1RA
T7EndonucleaseI(T7EI)是一種特殊的DNA內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn):1.**識(shí)別錯(cuò)配DNA**:T7EI能夠識(shí)別并切割不完全配對(duì)的DNA、十字型結(jié)構(gòu)DNA、Holliday結(jié)構(gòu)或交叉DNA以及異源雙鏈DNA。2.**切割位點(diǎn)**:T7EI切割錯(cuò)配位點(diǎn)5'端的、第二或第三個(gè)磷酸二酯鍵。3.**靈敏度**:T7EI對(duì)錯(cuò)配DNA的識(shí)別非常靈敏,能夠檢測(cè)并切割單堿基和多堿基的錯(cuò)配。4.**應(yīng)用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)導(dǎo)致的基因突變的鑒定。它通過(guò)識(shí)別錯(cuò)配DNA來(lái)幫助鑒定基因編輯是否成功以及是否有非目標(biāo)效應(yīng)。5.**直接電泳檢測(cè)**:T7EI的產(chǎn)物可以直接通過(guò)電泳進(jìn)行檢測(cè),這使得它在實(shí)驗(yàn)操作中更為方便。6.**來(lái)源**:T7EI來(lái)源于大腸桿菌菌株,是一種麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)和T7核酸內(nèi)切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:盡管T7EI在商業(yè)上使用時(shí)成本較高,但它在大規(guī)模樣本測(cè)試中,尤其是在基因突變鑒定方面,提供了一種有效的篩選方法。8.**特殊注意事項(xiàng)**:T7EI能夠識(shí)別長(zhǎng)度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯(cuò)配DNA,但不能識(shí)別1bp的插入、缺失或突變。這些特點(diǎn)使得T7EndonucleaseI成為基因突變鑒定中一個(gè)非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)的應(yīng)用中。Recombinant Human IL-1RA