浙江PNGaseF去糖基化酶

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-10-10

SialEXO 2-3 在天然條件下水解糖蛋白,在 pH 值范圍為 7.0 至 9.0 時(shí)顯示出活性。該酶來(lái)源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶具有 His 標(biāo)簽,分子量為 66 kDa。1. 用于方法開(kāi)發(fā)的靈活格式;2. 可以結(jié)合酶以提高用于離心柱中糖蛋白去唾液酸化的固定化酶。Genovis的SialEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的SialEXO酶,用于糖蛋白的去唾液酸化,而不會(huì)被酶污染z終制劑。它水解天然糖蛋白上的唾液酸(α2-3、α2-6 和 α2-8)并釋放出聚糖。效率;3. 適用于自動(dòng)化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。用于水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游離寡糖上的α1-2、α1-3和α1-4-連接巖藻糖殘基。浙江PNGaseF去糖基化酶

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使用Genovis的OpeRATOR圖譜O-聚糖位點(diǎn)對(duì)依那西普進(jìn)行LC-MS分析:依那西普是一種 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。將依那西普與OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促紅xibao生成素 (EPO) 是一種具有單個(gè) O-糖基化位點(diǎn)的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO進(jìn)行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通過(guò)反相LC-MS分析所得蛋白質(zhì)片段。O-糖基化的位點(diǎn)可以通過(guò)識(shí)別OeRATOR消化位點(diǎn)直接推斷出來(lái)。為了獲得良好性能,需要去除唾液酸助劑,因此購(gòu)買(mǎi)中包括2000個(gè)單位(如果SialEXO凍干)。1. 用于方法開(kāi)發(fā)的靈活產(chǎn)品形式;2. 可以結(jié)合酶以提高效率;3. 適用于自動(dòng)化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而該酶在N-聚糖上沒(méi)有活性。OpeRATOR和SialEXO處理后,O-糖基化蛋白被消化成攜帶O-聚糖的肽。消化發(fā)生在O-糖基化位點(diǎn)的N端。廣東固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究IgA 特異性O(shè)-糖肽富集:胰蛋白酶消化IgA。

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Genvis測(cè)試去除唾液酸以揭示電荷變體:唾液酸是帶負(fù)電荷的糖殘基,存在于 N- 和 O-連接的聚糖上。唾液酸的固有電荷可能會(huì)使分析工作流程復(fù)雜化,從而掩蓋其他重要的修飾。Microspin 色譜柱可用于 2 x 0.5 mg、5 x 0.5 mg 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白的去唾液酸化。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. 樣品中不含酶。因此,唾液酸的去除有助于研究蛋白質(zhì)中的潛在變體。該應(yīng)用展示了一種快速簡(jiǎn)便的樣品制備方法,可在電荷異構(gòu)體分析之前去除所有唾液酸。

水解O-聚糖的酶不會(huì)從變性中獲益,這就是為什么OmniGLYZOR色譜柱只能在天然條件下使用的原因。 OmniGLYZOR 試劑盒 Microspin 以含有足夠材料的試劑盒形式提供,可使5 × 50-100 μg 或 10 × 50-100 μg 糖蛋白去糖酸化。N-和O-連接聚糖的快速高效;與LC-MS兼容;完全去除聚糖,改進(jìn)基礎(chǔ)蛋白的分析;固定形式可提高酶與底物的比率,從而實(shí)現(xiàn)快速去糖基化。 IgdE酶(FabALACTICA?)和PNGaseF酶分別購(gòu)自Genovis(馬薩諸塞州,美國(guó))。用于水解糖蛋白上N-聚糖的凍干酶。Genovis的PNGase F 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 1000 或 5 x 1000 單位小瓶中,分別用于消化 1 mg 或 5 x 1 mg 糖蛋白。Genovis測(cè)試了 SialEXO 凍干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制劑上的性能。

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genvois的OpeRATOR 是一種內(nèi)切蛋白酶,可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽鍵的水解。內(nèi)切蛋白酶具有高特異性,可消化絲氨酸或蘇氨酸殘基的O-聚糖N端的蛋白質(zhì)。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖,并且該酶不會(huì)用 N-連接聚糖消化糖蛋白。該酶對(duì)具有亞洲化he心1 O-聚糖的位點(diǎn)z活躍。它還消化唾液酸化的he心 1 和he心 3,但程度要低得多。為了獲得z佳性能,需要去除唾液酸,因此,SialEXO凍干(唾液酸酶混合物)包含在購(gòu)買(mǎi)中。 GalNAcEXO 用于有效水解與糖蛋白(Tn 抗原)中的絲氨酸或蘇氨酸殘基相連的 α-N-乙酰半乳糖胺 (GalNAc)。湖北瑞典GenovisPNGaseF去糖基化酶生物藥物開(kāi)發(fā)

OmniGLYZOR Microspin 小柱中包含以下組分:PNGase?F;O-糖苷酶。浙江PNGaseF去糖基化酶

Genovis的ImpaRATOR? 可用于多種 O-聚糖:依那西普是一種融合蛋白,由TNF受體的胞外結(jié)構(gòu)域與人IgG1的Fc部分相連。該蛋白質(zhì)在Fc區(qū)域上方含有多達(dá)13個(gè)O-糖基化的Ser/Thr殘基簇,使其成為一種非常難以在結(jié)構(gòu)上表征的生物制藥。為了證明ImpaRATOR的聚糖特異性,制備了三種具有不同聚糖組成的依那西普樣品:(i)攜帶單唾液酸和二唾液酸化he心1結(jié)構(gòu)混合物的未經(jīng)處理的糖蛋白,(ii)用SialEXO處理的糖蛋白去除唾液酸并產(chǎn)生裸核1結(jié)構(gòu),以及(iii)用SialEXO和GalactEXO處理的糖蛋白產(chǎn)生單個(gè)GalNAc殘基, 也稱(chēng)為T(mén)n抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一鍋反應(yīng)中處理三個(gè)樣品(圖1)。作為比較,SialEXO處理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR處理。將所得肽還原、烷基化并用HILIC-MS進(jìn)行分析。FabRICATOR被包括在反應(yīng)中,以將Fc區(qū)與大多數(shù)C端糖肽分離,以促進(jìn)其表征。浙江PNGaseF去糖基化酶